SingleCellSignalR

DOI:10.18129 / B9.bioc.SingleCellSignalR

这是发展版本的SingleCellSignalR;稳定版请参见SingleCellSignalR．

使用单细胞RNAseq数据分析的细胞信号转导

Bioconductor版本:开发(3.14)

允许单细胞RNA序列数据分析，聚类，创建内部网络和推断细胞-细胞相互作用。

作者:Simon Cabello-Aguilar [aut]， Jacques Colinge [cre, aut]

维护者:Jacques Colinge < Jacques。Colinge at inserm.fr>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SingleCellSignalR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SingleCellSignalR”)

超文本标记语言	R脚本	my-vignette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，聚类，网络，RNASeq，SingleCell，软件
版本	1.5.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	BiocManager，circlize，limma，igraph，gplotsgrDevices,刨边机，SIMLR，data.table，pheatmap统计数据,Rtsne、图形、stringr，foreach，乘，食物,跑龙套
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	tidySingleCellExperiment
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SingleCellSignalR_1.5.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	SingleCellSignalR_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCellSignalR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SingleCellSignalR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SingleCellSignalR/
软件包下载报告	下载数据