SimBindProfiles

DOI:10.18129 / B9.bioc.SimBindProfiles

这是发展SimBindProfiles版本;稳定版请参见SimBindProfiles．

相似的绑定配置文件

Bioconductor版本:开发(3.17)

SimBindProfiles识别基因组平铺阵列数据中常见和唯一的结合区域。这个包不依赖于峰值调用，而是直接比较在同一数组平台上处理的绑定概要文件。它实现了一个简单的阈值方法，从而允许检索数据集之间的共同和差异绑定区域，以及补偿和增加绑定的事件。

作者:贝蒂娜·费舍尔，恩里科·费雷罗，罗伯特·斯托尼克，史蒂夫·拉塞尔

维护者:Bettina Fischer

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SimBindProfiles")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SimBindProfiles”)

PDF	R脚本	SimBindProfiles:相似的绑定配置文件，识别阵列基因组平铺阵列数据中常见和唯一的区域
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，软件
版本	1.37.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(9.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 2.10)，方法，林格
进口	limma，mclust，Biobase
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SimBindProfiles_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	SimBindProfiles_1.37.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	SimBindProfiles_1.37.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	SimBindProfiles_1.37.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SimBindProfiles
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SimBindProfiles
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SimBindProfiles/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SimBindProfiles/
软件包下载报告	下载数据