SeqVarTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqVarTools

这是发展SeqVarTools版本;稳定的发布版本,请参阅SeqVarTools

工具变量数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

一个接口的快速访问存储格式VCF SeqArray提供的数据,与常见的操作和分析的工具。

作者:斯蒂芬妮·m·Gogarten Xiuwen郑,艾德丽安Stilp

维护人员:斯蒂芬妮·m·Gogarten < sdmorris uw.edu >

从内部引用(R,回车引用(“SeqVarTools”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SeqVarTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SeqVarTools”)

PDF R脚本 介绍SeqVarTools
PDF R脚本 迭代器在SeqVarTools
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,测序,软件
版本 1.37.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (r - 3.0)(9.5年)
许可证 GPL-3
取决于 SeqArray
进口 grDevices、图形、数据、方法、Biobase,BiocGenerics,gdsfmt,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,logistf GWASExactHW矩阵,data.table
链接
建议 BiocStyleRUnit, stringr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/smgogarten/SeqVarTools
取决于我
进口我 《创世纪》
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SeqVarTools_1.37.0.tar.gz
Windows二进制 SeqVarTools_1.37.0.zip
macOS二进制(x86_64) SeqVarTools_1.37.0.tgz
macOS二进制(arm64) SeqVarTools_1.37.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SeqVarTools
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SeqVarTools/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqVarTools/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网