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- SeqVarTools(开发版)
SeqVarTools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqVarTools
这是发展SeqVarTools版本;稳定的发布版本,请参阅SeqVarTools。
工具变量数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
一个接口的快速访问存储格式VCF SeqArray提供的数据,与常见的操作和分析的工具。
作者:斯蒂芬妮·m·Gogarten Xiuwen郑,艾德丽安Stilp
维护人员:斯蒂芬妮·m·Gogarten < sdmorris uw.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SeqVarTools”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SeqVarTools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SeqVarTools”)
| R脚本 | 介绍SeqVarTools | |
| R脚本 | 迭代器在SeqVarTools | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,测序,软件 |
| 版本 | 1.37.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(9.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | SeqArray |
| 进口 | grDevices、图形、数据、方法、Biobase,BiocGenerics,gdsfmt,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,logistf GWASExactHW矩阵,data.table |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyleRUnit, stringr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/smgogarten/SeqVarTools |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 《创世纪》 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SeqVarTools_1.37.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SeqVarTools_1.37.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SeqVarTools_1.37.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SeqVarTools_1.37.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SeqVarTools |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SeqVarTools/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqVarTools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
