Scale4C

DOI:10.18129 / B9.bioc.Scale4C

这是发展Scale4C版本;稳定的发布版本,请参阅Scale4C。

Scale4C: R / Bioconductor包4 c-seq数据的尺度空间的转换

Bioconductor版本:发展(3.18)

Scale4C R / Bioconductor包4 c-seq数据的尺度空间变换和可视化。尺度空间的转换是一种多尺度可视化技术将二维信号(例如4 c-seq读取基因选择的间隔)成一个多边形密度在尺度空间(2 d基因组位置x比例因子)通过应用不同的平滑内核(高斯,随着σ)。这种转变使得探测的数据的分析和比较与其他样品的结构。

作者:卡罗琳沃尔特

维修工:卡罗琳沃尔特<卡罗琳。沃尔特在uni-muenster.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“Scale4C”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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PDF	R脚本	Scale4C: R / Bioconductor包4 c-seq数据的尺度空间的转换
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文本		新闻

细节

biocViews	报道,DataImport,质量控制,测序,软件,可视化
版本	1.23.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	R(> = 3.4),奶昔,GenomicRanges,IRanges,SummarizedExperiment
进口	方法、grDevices图形,跑龙套
链接
建议
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Scale4C_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	Scale4C_1.23.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	Scale4C_1.23.0.tgz
macOS二进制(arm64)	Scale4C_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Scale4C
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Scale4C
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Scale4C/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Scale4C/
包下载报告	下载数据