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- Bioconductor 3.17
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- SWATH2stats(开发版)
SWATH2stats
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SWATH2stats
这是发展SWATH2stats版本;稳定的发布版本,请参阅SWATH2stats。
转换和过滤片数据统计软件包
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个包是为了片OpenSWATH软件的数据转换成可读的格式由其他统计软件包在执行过滤、注释和罗斯福评估。
作者:彼得Blattmann (aut (cre)莫里茨Heusel (aut) Ruedi Aebersold (aut)
维护人员:彼得Blattmann < Blattmann在imsb.biol.ethz.ch >
从内部引用(R,回车引用(“SWATH2stats”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SWATH2stats”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SWATH2stats”)
| R脚本 | SWATH2stats示例脚本 | |
| R脚本 | SWATH2stats包装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,ExperimentalDesign,ImmunoOncology,MassSpectrometry,预处理,蛋白质组学,软件 |
| 版本 | 1.29.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.10.0) |
| 进口 | data.table,reshape2,ggplot2、统计、grDevices图形,跑龙套,biomaRt、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | MSstats,PECA,aLFQ |
| URL | https://peterblattmann.github.io/SWATH2stats/ |
| BugReports | https://github.com/peterblattmann/SWATH2stats |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SWATH2stats_1.29.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SWATH2stats_1.29.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SWATH2stats_1.29.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SWATH2stats_1.29.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SWATH2stats |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SWATH2stats |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SWATH2stats/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SWATH2stats/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
