- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- 追求者(开发版)
追求者
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SUITOR
这是发展版本的追求者;稳定的发布版本,请参阅追求者。
通过交叉验证选择突变特征的数量
Bioconductor版本:发展(3.18)
交叉验证的方法来选择最优数量的突变特征。突变数量的数据集分为训练和验证数据。签名估计在训练数据,然后用来预测验证数据的变异。
作者:DongHyuk李(aut),本·朱(aut),比尔•惠勒(cre)
维修工:比尔惠勒< wheelerb imsweb.com >
从内部引用(R,回车引用(“追求者”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“追求者”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“追求者”)
| R脚本 | 追求者:选择突变特征的数量 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 遗传学,软件,SomaticMutation |
| 版本 | 1.3.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 4.2.0) |
| 进口 | 统计数据、跑龙套、图形、ggplot2BiocParallel |
| 链接 | |
| 建议 | devtools,MutationalPatternsRUnit BiocManager,BiocGenerics,BiocStyle、knitr rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/wheelerb/SUITOR/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SUITOR_1.3.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | SUITOR_1.3.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SUITOR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/追求者 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SUITOR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SUITOR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
