STRINGdb

这是发展STRINGdb版本;稳定的发布版本,请参阅STRINGdb。

STRINGdb -蛋白质相互作用网络和功能富集分析

Bioconductor版本:发展(3.17)

STRINGdb包提供了一个R界面到字符串蛋白质相互作用数据库(https://string-db.org)。

作者:安德里亚•弗兰切斯基尼< andrea.franceschini在isb-sib.ch >

维护人员:达米安Szklarczyk <达米安。在imls.uzh.ch szklarczyk >

从内部引用(R,回车引用(“STRINGdb”)):

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“STRINGdb”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“STRINGdb”)