分裂

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER

这是发展SPLINTER版本;稳定版请参见分裂．

文本的拼接解释器

Bioconductor版本:开发(3.16)

提供工具来分析替代剪接位点，根据序列信息解释结果，选择和设计引物进行位点验证，并给出事件的可视化表示，以指导下游实验。

作者:Diana Low [aut, cre]

维护者:Diana Low

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SPLINTER")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“分裂”)

PDF	R脚本	分裂
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，软件，可视化
版本	1.23.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6.0)， grDevices, stats
进口	图形,ggplot2，seqLogo，Biostrings，biomaRt，GenomicAlignments，GenomicRanges，GenomicFeatures，Gviz，IRanges，S4Vectors，GenomeInfoDb跑龙套,plyr，stringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，googleVis
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/dianalow/SPLINTER/
BugReports	https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SPLINTER_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	SPLINTER_1.23.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SPLINTER
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/
软件包下载报告	下载数据