- 家
- Bioconductor 3.14
- 软件包
- SIMAT(开发版)
SIMAT
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SIMAT
这是发展SIMAT版本;稳定的发布版本,请参阅SIMAT。
GC-SIM-MS数据处理和alaysis工具
Bioconductor版本:发展(3.14)
这个包提供了一个分析的管道在gc - ms数据选择离子监测模式(SIM)。该工具还提供了一个指导在选择合适的碎片感兴趣的目标通过使用一个优化算法。这是通过考虑重叠峰从图书馆由用户提供。
作者:m . r . Nezami Ranjbar < nranjbar vt.edu >
维护人员:m . r . Nezami Ranjbar < nranjbar vt.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SIMAT”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SIMAT”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SIMAT”)
| R脚本 | SIMAT用法 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
| 版本 | 1.25.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(6年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),Rcpp(> = 0.11.3) |
| 进口 | mzR,ggplot2、网格reshape2,统计grDevices跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://omics.georgetown.edu/SIMAT.html |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SIMAT_1.25.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | SIMAT_1.25.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SIMAT |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SIMAT |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SIMAT/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
