- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- SEtools(开发版)
SEtools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SEtools
这是发展SEtools版本;稳定的发布版本,请参阅SEtools。
为处理SummarizedExperiment SEtools:工具
Bioconductor版本:发展(3.16)
这包括一套工具来处理SummarizedExperiment类,包括合并、融化,聚合函数。绘图功能在历史上在这个包中被移到sechm包。
作者:Pierre-Luc日尔曼(cre, aut)
维护人员:Pierre-Luc日尔曼< Pierre-Luc。日尔曼在hest.ethz.ch >
从内部引用(R,回车引用(“SEtools”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SEtools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SEtools”)
| HTML | R脚本 | SEtools |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,软件 |
| 版本 | 1.11.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(3年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | BiocParallel,矩阵,SummarizedExperiment,DESeq2,S4Vectors,data.table,刨边机,openxlsx统计数据,股东价值分析,sechm |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,ggplot2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/plger/SEtools |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SEtools_1.11.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SEtools_1.11.0.zip(64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | SEtools_1.11.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEtools |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SEtools |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SEtools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
