SEPIRA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEPIRA

这是发展SEPIRA版本;稳定版请参见SEPIRA．

调控活动的系统表观基因组推断

Bioconductor版本:开发(3.17)

SEPIRA(系统表观基因组学调控活性推断)是一种算法，从样本的全基因组表达或DNA甲基化轮廓推断样本特异性转录因子活性。

作者:Yuting Chen [aut, cre]， Andrew Teschendorff [aut]

维护者:Yuting Chen

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SEPIRA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SEPIRA”)

超文本标记语言	R脚本	“SEPIRA”简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneRegulation，GeneTarget，网络，NetworkInference，软件，转录
版本	1.19.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	limma(> = 3.32.5),corpcor(>= 1.6.9)，并行(>= 3.3.1)，统计
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，igraph
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SEPIRA_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	SEPIRA_1.19.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	SEPIRA_1.19.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	SEPIRA_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEPIRA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SEPIRA
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SEPIRA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SEPIRA/
软件包下载报告	下载数据