- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- SDAMS(开发版)
SDAMS
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SDAMS
这是发展SDAMS版本;稳定的发布版本,请参阅SDAMS。
丰富/差异表达分析代谢组学、蛋白质组学和RNA单细胞测序数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个包利用Semi-parametric微分丰富/表达分析(SDA)方法对代谢组学和蛋白质组学质谱数据以及单细胞RNA序列数据。SDA能够有效地处理非正态分布数据和提供了明确的量化的影响大小。
作者:李Yuntong < Yuntong。李在uky.edu >,Chi Wang
维护人员:李Yuntong < Yuntong。李在uky.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SDAMS”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SDAMS”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SDAMS”)
| R脚本 | SDAMS装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.19.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 3.5),SummarizedExperiment |
| 进口 | 信任,qvalue、方法、统计跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SDAMS_1.19.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SDAMS_1.19.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SDAMS_1.19.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SDAMS_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SDAMS |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SDAMS |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SDAMS/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SDAMS/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
