SCnorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCnorm

这是发展SCnorm的版本;稳定发布版本请参见SCnorm．

单细胞RNA-seq数据的归一化

Bioconductor版本:开发(3.17)

这个包实现了SCnorm -一种规范化单细胞RNA-seq数据的方法。

作者:朗达·巴赫

维护者:Rhonda Bacher

安装

要安装此包，启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SCnorm")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“SCnorm”)

PDF	R脚本	SCnorm装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，归一化，RNASeq，SingleCell，软件
版本	1.21.0
在Bioconductor公司	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，统计，方法，图形，grDevices，并行，quantreg，集群，时刻，data.table，BiocParallel，S4Vectors，ggplot2，forcats，BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，devtools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/rhondabacher/SCnorm
BugReports	https://github.com/rhondabacher/SCnorm/issues
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SCnorm_1.21.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SCnorm
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SCnorm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SCnorm/
软件包下载报告	下载数据