短链脂肪酸

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCFA

这是发展SCFA版本;稳定版请参见短链脂肪酸。

SCFA:通过共识因子分析进行细分

Bioconductor版本:开发(3.17)

一致性因子分析(SCFA)可以有效地去除多组学数据中一致分子模式中的噪声信号。SCFA首先使用自编码器只选择重要的特征，然后重复执行因子分析，以表示具有不同数量因子的数据。使用这些表示，它可以可靠地识别癌症亚型，并准确预测患者的风险评分。

作者:Duc Tran [aut, cre]， Hung Nguyen [aut]， Tin Nguyen [fre]

维护者:Duc Tran <管道at nevada.unr.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SCFA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SCFA”)

超文本标记语言	R脚本	SCFA包装手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，聚类，软件，生存
版本	1.9.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	LGPL
取决于	R (>= 4.0)
进口	matrixStats，BiocParallel，火炬(> = 0.3.0),重复，igraph，矩阵，集群，clusterCrit，心理，glmnet，RhpcBLASctl，统计，utils，方法，生存
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/duct317/SCFA
BugReports	https://github.com/duct317/SCFA/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SCFA_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	SCFA_1.9.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	SCFA_1.9.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	SCFA_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCFA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SCFA
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SCFA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SCFA/
软件包下载报告	下载数据