这是发展SCBN版本;稳定的发布版本,请参阅SCBN。
Bioconductor版本:发展(3.18)
这个包提供了一个基于规模的标准化(SCBN)方法来识别不同物种之间的基因差异表达。它考虑守恒的直系同源基因的可用知识和假设检验框架来检测差异表达同源基因。本文中描述的方法在这个包的一个统计RNA-seq数据的归一化法和微分表达式分析不同物种的燕周、朱Jiadi,铁军,冰清林Junhui Wang Jun张(2018年,即将出版)。
作者:燕周
维修工:燕周在email.szu.edu.cn < 2160090406 >
从内部引用(R,回车引用(“SCBN”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SCBN”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SCBN”)
HTML | R脚本 | SCBN教程 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,归一化,软件 |
版本 | 1.19.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.5.0) |
进口 | 统计数据 |
链接 | |
建议 | knitr rmarkdown,BiocStyle,BiocManager |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | TEKRABber |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | SCBN_1.19.0.tar.gz |
Windows二进制 | SCBN_1.19.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | SCBN_1.19.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | SCBN_1.19.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCBN |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCBN |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SCBN/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SCBN/ |
包下载报告 | 下载数据 |