Scarray
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.scarray
这是发展Scarray的版本；对于稳定版本，请参阅Scarray。
带有GDS文件的大型单细胞RNA-seq数据操作
生物导体版本：开发（3.16）
使用基因组数据结构（GDS）文件提供大规模的单细胞RNA-seq数据操作。它结合了存储在GDS文件中的密集和稀疏矩阵以及使用R编程语言的生物导体基础架构框架（SingleCellexperiment和delayerDarray），以提供存储外数据存储和大规模操作。
作者：Xiuwen Zheng [AUT，CRE]
维护者：xiuwen Zheng
引用（从r内，输入引用（“ scarray”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ scarray”）的用法
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Scarray”）
| html | 概述 | |
| html | R脚本 | 使用GDS文件的单细胞RNA-seq数据操作 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件 |
| 版本 | 1.5.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（8年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），GDSFMT（> = 1.27.4），方法，延迟（> = 0.16.0） |
| 进口 | 生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，utils，总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，延迟的matrixstats |
| 链接 | |
| 建议 | 矩阵，，，，评分，，，，UWOT，，，，运行，，，，尼特，，，，降价，，，，rmarkDown，，，，RHDF5，，，，HDF5Array |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/abbvie-computationalgenomics/scarray |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | scarray_1.5.0.tar.gz |
| Windows二进制 | scarray_1.5.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | scarray_1.5.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scarray |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/scarray |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scarray/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
