Rqc

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rqc

这是发展Rqc版本;稳定版请参见Rqc．

高通量测序数据的质量控制工具

Bioconductor版本:开发(3.14)

Rqc是一种用于高通量测序数据质量控制和评估的优化工具。它对整个文件进行并行处理，并生成包含一组高分辨率图形的报告。

作者:Welliton Souza, Benilton Carvalho

维护者:Welliton Souza

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("Rqc")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Rqc”)

超文本标记语言	R脚本	使用Rqc
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，质量控制，测序，软件
版本	1.27.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	BiocParallel，ShortRead，ggplot2
进口	BiocGenerics(> = 0.25.1),Biostrings，IRanges、方法、S4Vectors，knitr(> = 1.7),BiocStyle，plyr，减价、网格reshape2，Rcpp(> = 0.11.6),biovizBase，闪亮的，Rsamtools，GenomicAlignments，GenomicFiles
链接	Rcpp
建议	testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/labbcb/Rqc
BugReports	https://github.com/labbcb/Rqc/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Rqc_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	Rqc_1.27.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	Rqc_1.27.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rqc
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rqc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Rqc/
软件包下载报告	下载数据