RolDE

DOI:10.18129 / B9.bioc.RolDE

这是发展RolDE版本;稳定的发布版本,请参阅RolDE。

RolDE:健壮的纵向微分表达式

Bioconductor版本:发展(3.17)

RolDE检测纵向两个条件在嘈杂的high-troughput数据之间的微分表达式。甚至适合数据与适度的缺失值。RolDEis a composite method, consisting of three independent modules with different approaches to detecting longitudinal differential expression. The combination of these diverse modules allows RolDE to robustly detect varying differences in longitudinal trends and expression levels in diverse data types and experimental settings.

作者:Tommi Valikangas (cre, aut)

维护人员:Tommi Valikangas < tsvali在utu.fi >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RolDE”)

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文档

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细节

biocViews	DifferentialExpression,蛋白质组学,回归,软件,StatisticalMethod,TimeCourse
版本	1.3.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	统计数据、方法腐烂,matrixStats,foreach平行,doParallel,doRNG,rngtools,SummarizedExperiment,nlme,qvalue、grDevices图形,跑龙套
链接
建议	knitr,printr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/elolab/RolDE
BugReports	https://github.com/elolab/RolDE/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RolDE_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	RolDE_1.3.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	RolDE_1.3.0.tgz
macOS二进制(arm64)	RolDE_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RolDE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RolDE
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RolDE/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RolDE/
包下载报告	下载数据