rnbeads

doi：10.18129/b9.bioc.rnbeads

这是发展rnbeads的版本；对于稳定版本，请参阅rnbeads。

rnbeads

生物导体版本：开发（3.16）

RNBEADS促进了对基因组量表各种类型的DNA甲基化数据的全面分析。

作者：Yassen Assenov [Aut]，Christoph Bock [AUT]，Pavlo Lutsik [AUT]，Michael Scherer [AUT]，Fabian Mueller [Aut，CRE]

维护者：Fabian Mueller 的团队>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ rnbeads”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rnbeads”）

PDF	R脚本	综合DNA甲基化分析与RNBEADS
PDF	R脚本	rnbeads注释
PDF		参考手册
文本		读书我
文本		消息

细节

生物浏览	批处理效应，，，，CPGISLAND，，，，DNAMETHYLATY，，，，DataImport，，，，差甲基化，，，，表观遗传学，，，，免疫学，，，，甲基，，，，甲基化array，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，测序，，，，软件，，，，两通道
版本	2.15.1
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.0.0），生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.9.25），基因组机，，，，大量的，，，，簇，，，，ff，，，，字段，，，，GGPLOT2（> = 0.9.2），GPLOTS， 网格，栅格，，，，林玛，，，，矩阵， 方法，Illuminaio，，，，甲基菌，，，，plyr
进口	iranges
链接
建议	类别，，，，gostats，，，，GVIZ，，，，Illuminahumanmethylation450Kmanifest，，，，rpmm，，，，rnbeads.hg19，，，，rnbeads.mm9，，，，XML，，，，注释，，，，Biomart，，，，foreach，，，，多帕尔，，，，GGBIO，，，，ISVA，，，，mclust，，，，MGCV，，，，Minfi，，，，nlme，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，org.rn.eg.db，，，，Quadprog，，，，rtracklayer，，，，QVALUE，，，，SVA，，，，西瓜，，，，WordCloud，，，，QVALUE，，，，argparse，，，，Glmnet，，，，高兴的，，，，Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19，，，，秤，，，，甲基小姐，，，，算，，，，闪亮的，，，，Shinyjs，，，，plotrix，，，，Hexbin，，，，运行，，，，甲基赛克，，，，芝麻
系统要求
增强
URL
取决于我	玛格尔
进口我
建议我	rnbeads.hg19，，，，rnbeads.hg38，，，，rnbeads.mm10，，，，rnbeads.mm9，，，，rnbeads.rn5
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rnbeads_2.15.1.tar.gz
Windows二进制	rnbeads_2.15.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	rnbeads_2.15.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnbeads
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rnbeads
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/rnbeads/
软件包下载报告	下载统计