- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- Rmagpie(开发版)
Rmagpie
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.Rmagpie
这是发展Rmagpie版本;稳定的发布版本,请参阅Rmagpie。
微阵列Gene-expression-based错误率评估程序
Bioconductor版本:发展(3.18)
微阵列分类是专为生物学家和统计学家。它提供的能力训练贴上微阵列数据集上的分类器,然后用分类器预测类的新观察。一系列的现代分类器是可用的,包括支持向量机(svm),最近的萎缩质心(nsc)…先进的方法来估计预测错误率和报告提供的基因子集基本出现在类之间的差别。
作者:卡米尔Maumet < Rmagpie gmail.com >, c . Ambroise j·朱的贡献
维护人员:卡米尔Maumet < Rmagpie gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“Rmagpie”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“Rmagpie”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Rmagpie”)
| R脚本 | Rmagpie例子 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 分类,微阵列,软件 |
| 版本 | 1.57.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(14年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | R (> = 2.6.1),Biobase(> = 2.5.5) |
| 进口 | Biobase(> = 2.5.5)e1071、图形grDevices, kernlab,方法,pamr,统计,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | xtable |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Rmagpie_1.57.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Rmagpie_1.57.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | Rmagpie_1.57.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | Rmagpie_1.57.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rmagpie |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rmagpie |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/Rmagpie/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rmagpie/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
