RefPlus

DOI:10.18129 / B9.bioc.RefPlus

这是发展RefPlus版本;稳定版请参见RefPlus

外推策略(RMA+)和外推平均(RMA++)方法的函数集。

Bioconductor版本:开发(3.17)

该包包含使用RMA+和RMA++方法对Affymetrix数据进行预处理的函数。

作者:张启明, Chris Harbron , Marie C South

维护者:Kai-Ming Chang

引文(从R内,输入引用(“RefPlus”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("RefPlus")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RefPlus”)

PDF R脚本 RefPlus手册
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel预处理软件
版本 1.69.0
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(15.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.8.0),Biobase(> =魅惑,affy(> = 1.20.0),affyPLM(> = 1.18.0),preprocessCore(> = 1.4.0)
进口
链接
建议 affydata
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RefPlus_1.69.0.tar.gz
Windows二进制 RefPlus_1.69.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) RefPlus_1.69.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) RefPlus_1.69.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RefPlus
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RefPlus
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RefPlus/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RefPlus/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网