ReQON

DOI:10.18129 / B9.bioc.ReQON

这是发展ReQON版本;稳定版请参见ReQON．

重新校准核苷酸的质量

Bioconductor版本:开发(3.17)

重新校准BAM格式对齐测序数据的基础质量分数的算法。

作者:Christopher Cabanski, Keary Cavin, Chris Bizon

维护者:Christopher Cabanski

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ReQON")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ReQON”)

PDF	R脚本	ReQON教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	HighThroughputSequencing，预处理，质量控制，测序，软件
版本	1.45.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(11年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.0.2)，Rsamtools，seqbias
进口	rJava，图形，统计，utils, grDevices
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements	Java版本>= 1.6
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ReQON_1.45.0.tar.gz
Windows二进制	ReQON_1.45.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ReQON_1.45.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ReQON
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ReQON
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ReQON/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ReQON/
软件包下载报告	下载数据