- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- RcwlPipelines(开发版)
RcwlPipelines
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DOI:10.18129 / B9.bioc.RcwlPipelines
这是发展RcwlPipelines版本;稳定的发布版本,请参阅RcwlPipelines。
基于Rcwl生物信息学管道
Bioconductor版本:发展(3.18)
的生物信息学工具和管道基于R和通用工作流语言。
作者:羌胡(aut (cre),钱氏(aut),双高(aut)
维修工:羌胡<羌族。胡在roswellpark.org >
从内部引用(R,回车引用(“RcwlPipelines”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RcwlPipelines”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 对齐,DNASeq,DataImport,ImmunoOncology,预处理,质量控制,RNASeq,软件,WorkflowStep |
| 版本 | 1.17.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(4年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.6),Rcwl,BiocFileCache |
| 进口 | rappdirs、方法、效用,git2r httr,S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | testthat、knitr rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | nodejs |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | ReUseData |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | RcwlPipelines_1.17.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RcwlPipelines |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RcwlPipelines |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/RcwlPipelines/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RcwlPipelines/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
