Rcwl

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rcwl

这是发展Rcwl版本;稳定的发布版本,请参阅Rcwl。

R接口通用工作流语言

Bioconductor版本:发展(3.17)

通用工作流语言(CWL)是一种开放标准开发便携和可伸缩的数据分析工作流程在不同的工具和工作环境。Rcwl封装命令行工具,并提供了一个简单的方法构建CWL数据分析管道在r .它增加了方便使用的编程,开发和维护CWL管道。

作者:羌胡(aut (cre),钱氏(aut)

维修工:羌胡<羌族。胡在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“Rcwl”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Rcwl”)

HTML	R脚本	通用工作流Rcwl: R接口语言
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ImmunoOncology,软件,WorkflowStep
版本	1.15.5
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	GPL-2 |文件许可证
取决于	R (> = 3.6),yaml、方法、S4Vectors
进口	跑龙套,统计数据,BiocParallel,batchtools,图,闪亮的,R.utils,codetools,蛇怪
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	RcwlPipelines
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Rcwl_1.15.5.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)	Rcwl_1.15.5.tgz
macOS二进制(arm64)	Rcwl_1.15.5.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rcwl
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rcwl
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Rcwl/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Rcwl/
包下载报告	下载数据