rbowtie

doi:10.18129/b9.bioc.rbowtie

这是发展rbowtie的版本;对于稳定版本,请参阅rbowtie

R Bowtie包装纸

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包为受欢迎的Bowtie Short Read Aligner和SpliceMap(从头剪接连接发现和对齐工具)提供了R包装。该软件包由Quasr Bioconductor软件包使用。我们建议使用Quasr软件包,而不是直接使用rbowtie。

作者:Florian Hahne,Anita Lerch,Michael B Stadler

维护者:迈克尔·斯塔德勒(Michael Stadler)<迈克尔·斯塔德勒

引用(从r内,输入引用(“ rbowtie”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ rbowtie”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ rbowtie”)

html R脚本 rbowtie介绍
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 结盟,,,,测序,,,,软件
版本 1.37.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9。5年)
执照 Artistic-2.0 |文件执照
要看
进口
链接
建议 测试, 平行,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求 gnu做
增强
URL https://github.com/fmicompbio/rbowtie
BugReports https://github.com/fmicompbio/rbowtie/issues
取决于我
进口我 Crisprbowtie,,,,Macpet,,,,Multicrispr
建议我 艾萨尔
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rbowtie_1.37.0.tar.gz
Windows二进制 rbowtie_1.37.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rbowtie_1.37.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rbowtie
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rbowtie
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rbowtie/
软件包下载报告 下载统计

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