旅游房车

DOI:10.18129 / B9.bioc.RVS

这是发展RVS版本;稳定版请参见旅游房车．

计算相关个体共享罕见变异的概率估计值

Bioconductor版本:开发(3.17)

罕见变异共享(RVS)实现了在家族样本中罕见遗传变异基因型和二分表型(例如疾病状态)之间的关联和联系的测试。这些测试是基于稀有变异与表型之间不存在联系和关联的原假设下亲属间共享稀有变异的概率，适用于一个地区的单个变异或多个变异(例如基于基因的测试)。

作者:Alexandre Bureau, Ingo Ruczinski, Samuel Younkin, Thomas Sherman

维护者:Thomas Sherman

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("RVS")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“旅游房车”)

超文本标记语言	R脚本	RVS套装
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExomeSeq，遗传学，GenomeWideAssociation，ImmunoOncology，软件，VariantDetection，WholeGenome
版本	1.21.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	GENLIB，粮食，snpStats，kinship2，方法，统计，utils
链接
建议	knitr，testthat，rmarkdown，BiocStyle，VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RVS_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	RVS_1.21.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	RVS_1.21.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	RVS_1.21.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RVS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RVS
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RVS/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RVS/
软件包下载报告	下载数据