Ruvseq
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doi：10.18129/b9.bioc.ruvseq
这是发展Ruvseq的版本;对于稳定版本，请参阅Ruvseq。
从RNA-Seq数据中删除不需要的变化
生物导体版本：开发（3.14）
该软件包实现了Risso等人的删除不需要的变化（RUV）方法。（2014）用于在样品之间进行RNA-Seq读数的归一化。
作者：Davide Risso [AUT，CRE，CPH]，Sandrine Dudoit [aut]，Lorena Pantano [CTB]，Kamil Slowikowski [CTB]
维护者：davide risso
引用（从r内，输入引用（“ ruvseq”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）＃以下初始化了Bioc devel Biocmanager :: install（vaster（version ='devel'）biocmanager :: install（“ ruvseq”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ ruvseq”）
| R脚本 | RUVSEQ：从RNA-Seq数据中删除不需要的变化 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，免疫学，，，，预处理，，，，rnaseq，，，，软件 |
| 版本 | 1.27.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 生物酶，，，，EDASEQ（> = 1.99.1），EDGER |
| 进口 | 方法，大量的 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rcolorbrewer，，，，斑马鱼，，，，deseq2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/drisso/ruvseq |
| BugReports | https://github.com/drisso/ruvseq/issues |
| 取决于我 | rnaseqgene |
| 进口我 | 共识，，，，RibosomeProfilingQC，，，，烤饼 |
| 建议我 | DESCAN2 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ruvseq_1.27.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ruvseq_1.27.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | ruvseq_1.27.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ruvseq |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ruvseq |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ruvseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
