RNAmodR。AlkAnilineSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR.AlkAnilineSeq

这是发展RNAmodR.AlkAnilineSeq;稳定版请参见RNAmodR。AlkAnilineSeq

AlkAnilineSeq检测m7G, m3C和D的修饰

Bioconductor版本:开发(3.17)

RNAmodR。AlkAnilineSeq从AlkAnilineSeq协议生成的实验数据中检测RNA上的m7G, m3C和D修饰。该包构建在RNAmodR包的核心功能之上,用于检测高通量测序数据中修改的特定模式。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre],丹尼斯·拉方丹[ctb, nd]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

引文(从R内,输入引用(“RNAmodR.AlkAnilineSeq”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("RNAmodR.AlkAnilineSeq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAmodR.AlkAnilineSeq”)

超文本标记语言 R脚本 RNAmodR。AlkAnilineSeq
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 测序软件可视化WorkflowStep
版本 1.13.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),RNAmodR(> = 1.5.3)更正
进口 方法,S4VectorsIRangesBiocGenericsGenomicRangesGviz
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatrtracklayerBiostringsRNAmodR。数据
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq
BugReports https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.AlkAnilineSeq/issues
全靠我
进口我
建议我 RNAmodR。毫升
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.13.0.tar.gz
Windows二进制 RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.13.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.13.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) RNAmodR.AlkAnilineSeq_1.13.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RNAmodR.AlkAnilineSeq/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAmodR.AlkAnilineSeq/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网