- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- RNAinteract(开发版)
RNAinteract
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAinteract
这是发展RNAinteract版本;稳定的发布版本,请参阅RNAinteract。
估计成对从多维交互功能
Bioconductor版本:发展(3.18)
RNAinteract估计基因相互作用等多维家里从图像中提取特征。屏幕被认为是进行多井盘子或类似的设计。从一个列表的功能(如细胞数量、面积、荧光强度)每好,估计遗传交互。包提供了交互功能报告基因对,策划的热图和双RNAi情节。可以编写一个HTML报告质量控制和分析。
作者:贝恩德•费舍尔(aut),沃尔夫冈•休伯[所有]Mike Smith (cre)
维护人员:迈克史密斯<迈克。史密斯在embl.de >
从内部引用(R,回车引用(“RNAinteract”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“RNAinteract”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RNAinteract”)
| R脚本 | RNAinteract | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CellBasedAssays,ImmunoOncology,预处理,质量控制,软件,可视化 |
| 版本 | 1.49.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(12年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.12.0) |
| 进口 | ICSNP RColorBrewer,集成电路,cellHTS2,geneplotter、gplots、网格hwriter、晶格latticeExtra,limma、方法、splots(> = 1.13.12)、abind locfit,Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | RNAinteractMAPK |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RNAinteract_1.49.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RNAinteract_1.49.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | RNAinteract_1.49.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAinteract |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAinteract |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/RNAinteract/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
