rnaagecalc

doi:10.18129/b9.bioc.rnaagecalc

这是发展RnaageCalc的版本;对于稳定版本,请参阅rnaagecalc

多组织转录年龄计算器

生物导体版本:开发(3.16)

已经表明,DNA甲基化和RNA转录都与年龄和年龄相关疾病有关。已经开发了几个估计量来预测DNA水平和RNA水平的人类衰老。大多数人的转录年龄预测因子基于微阵列数据,仅限于几个组织。迄今为止,使用来自不同人体组织的RNASEQ数据进行衰老的转录研究受到限制。该软件包的目的是为基于GTEX RNASEQ数据提供跨组织和组织特异性转录年龄计算的工具。

作者:Xu Ren [AUT,CRE],PEI FEN KUAN [AUT]

维护者:Xu Ren

引用(从r内,输入引用(“ rnaagecalc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ rnaagecalc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rnaagecalc”)

html R脚本 rnaagecalc
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,rnaseq,,,,软件
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.6)
进口 GGPLOT2,,,,叙事,,,,,,,,AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,统计总结性特征, 方法
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/reese3928/rnaagecalc
BugReports https://github.com/reese3928/rnaagecalc/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rnaagecalc_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 rnaagecalc_1.9.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rnaagecalc_1.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaagecalc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rnaagecalc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaagecalc/
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