这是发展RnaageCalc的版本;对于稳定版本,请参阅rnaagecalc。
生物导体版本:开发(3.16)
已经表明,DNA甲基化和RNA转录都与年龄和年龄相关疾病有关。已经开发了几个估计量来预测DNA水平和RNA水平的人类衰老。大多数人的转录年龄预测因子基于微阵列数据,仅限于几个组织。迄今为止,使用来自不同人体组织的RNASEQ数据进行衰老的转录研究受到限制。该软件包的目的是为基于GTEX RNASEQ数据提供跨组织和组织特异性转录年龄计算的工具。
作者:Xu Ren [AUT,CRE],PEI FEN KUAN [AUT]
维护者:Xu Ren
引用(从r内,输入引用(“ rnaagecalc”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ rnaagecalc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rnaagecalc”)
html | R脚本 | rnaagecalc |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,rnaseq,,,,软件 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | GGPLOT2,,,,叙事,,,,算,,,,AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,统计总结性特征, 方法 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/reese3928/rnaagecalc |
BugReports | https://github.com/reese3928/rnaagecalc/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rnaagecalc_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | rnaagecalc_1.9.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | rnaagecalc_1.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaagecalc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rnaagecalc |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaagecalc/ |
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