rmassbank

doi：10.18129/b9.bioc.rmassbank

这是发展Rmassbank的版本；对于稳定版本，请参阅rmassbank。

处理串联MS文件并构建Massbank记录的工作流程

生物导体版本：开发（3.16）

工作流程以处理串联MS文件并构建Massbank记录。功能包括串联MS光谱的自动提取，对串联MS片段的公式分配，带有分配片段的串联MS光谱，光谱清理，从Internet数据库中自动检索化合物信息以及导出到Massbank Records。

作者：Michael Stravs，Emma Schymanski，Steffen Neumann，Erik Mueller，来自Tobias Schulze的贡献

维护者：Eawag

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ rmassbank”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ rmassbank”）

html	R脚本	RMASSBANK用于XCMS
html	R脚本	rmassbank：非标准用法
html	R脚本	rmassbank：以身作用的工作流程
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	生物信息学，，，，免疫学，，，，质谱，，，，代谢组学，，，，软件
版本	3.7.1
在生物导体中	Bioc 2.11（R-2.15）（10年）
执照	艺术2.0
要看	RCPP
进口	XML，，，，rjson，，，，S4VECTORS，，，，消化，，，，rcdk，，，，Yaml，，，，MZR， 方法，生物酶，，，，MSNBase，，，，httr，，，，Envipat，，，，断言，，，，记录器，，，，rcurl，，，，readjdx，，，，网络化学，，，，化学机器，，，，Chemmineob，，，，r.utils，，，，Data.Table
链接
建议	生物使用，，，，GPLOTS，，，，rmassbankdata（> = 1.33.1），XCMS（> = 1.37.1），相机，，，，运行，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求	OpenBabel
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	rmassbankdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rmassbank_3.7.1.tar.gz
Windows二进制	rmassbank_3.7.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	rmassbank_3.7.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rmassbank
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rmassbank
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/rmassbank/
软件包下载报告	下载统计