日坛

DOI:10.18129 / B9.bioc.RITAN

这是发展日坛版本;稳定的发布版本,请参阅日坛

术语注释和快速整合网络资源

Bioconductor版本:发展(3.17)

全面的基因集富集和提取工具multi-resource高信心子网。日坛促进生物信息学任务启用网络生物学研究。

作者:迈克尔·齐默尔曼(aut (cre)

维护人员:迈克尔-齐默尔曼说:< mtzimmermann mcw.edu >

从内部引用(R,回车引用(“日坛”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“日坛”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“日坛”)

HTML R脚本 选择资源
HTML R脚本 浓缩装饰图案
HTML R脚本 Multi-Tissue分析
HTML R脚本 网络生物学装饰图案
HTML R脚本 资源之间的关系
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews FunctionalGenomics,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,网络,NetworkEnrichment,NetworkInference,质量控制,软件
版本 1.23.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证 文件许可证
取决于 R (> = 4.0)
进口 图形、方法、统计跑龙套、网格gridExtra,reshape2,gplots,ggplot2,plotrix,RColorBrewer,STRINGdb,制程,linkcomm,dynamicTreeCut,gsubfn,哈希,png,sqldf,igraph,BgeeDB,knitr,RITANdata,GenomicFeatures,ensembldb,AnnotationFilter,EnsDb.Hsapiens.v86
链接
建议 rmarkdown,BgeeDB
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 RITAN_1.23.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RITAN
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/日坛
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RITAN/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网