R4RNA

DOI:10.18129 / B9.bioc.R4RNA

这是发展R4RNA的版本;稳定版请参见R4RNA．

用于RNA可视化和分析的R包

Bioconductor版本:开发(3.16)

RNA碱基对分析包，包括碱基对的可视化弧线图，便于序列和结构的比较和注释。弧线图还可以投影到多个序列校准上，以评估碱基对守恒和共变，并使用数值方法计算每种统计数据。

作者:Daniel Lai, Irmtraud Meyer < Irmtraud。Meyer在cantab.net>

维护者:Daniel Lai

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("R4RNA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“R4RNA”)

PDF	R脚本	R4RNA.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，DataImport，DataRepresentation，MultipleComparison，MultipleSequenceAlignment，预处理，软件，可视化
版本	1.25.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.2.0)，Biostrings(> = 2.38.0)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.e-rna.org/r-chie/
全靠我
进口我	ggmsa
建议我	rfaRm
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	R4RNA_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	R4RNA_1.25.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	R4RNA_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R4RNA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/R4RNA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/R4RNA/
软件包下载报告	下载数据