R453plus1toolbox
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doi：10.18129/b9.bioc.r453plus1toolbox
这是发展R453plus1toolbox的版本;对于稳定版本，请参阅R453plus1toolbox。
用于导入和分析罗氏基因组序列系统数据的软件包
生物导体版本：开发（3.16）
R453PLUS1工具箱包括有用的功能，用于分析Roche的454测序平台生成的数据。它为质量保证以及检测到的变体的注释和可视化添加了功能，并补充了Roche与其产品一起运送的软件工具。此外，还提供了检测结构变体的管道。
作者：汉斯·乌尔里希·克莱因（Hans-Ulrich Klein），克里斯托夫·巴滕哈根（Christoph Bartenhagen），克里斯蒂安
维护者：hans-ulrich klein
引用（从r内，输入引用（“ R453plus1toolbox”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install（version（version ='devel'）biocmanager :: install（“ r453plus1toolbox”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ R453plus1toolbox”）
| R脚本 | 用于导入和分析罗氏基因组序列系统数据的软件包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，QualityControl，，，，报告写作，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.47.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.7（R-2.12）（11。5年） |
| 执照 | LGPL-3 |
| 要看 | r（> = 2.12.0），方法，变体（> = 1.25.11），生物弦（> = 2.47.6），生物酶 |
| 进口 | UTILS，GRDEVICES，图形，统计，工具，Xtable，，，，R2HTML，，，，Deachertimos，，，，生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.17.25），iranges（> = 2.13.12），xvector，，，，基因组机（> = 1.31.8），总结性特征，，，，Biomart，，，，BSGENOME（> = 1.47.3），rsamtools，，，，Shortread（> = 1.37.1） |
| 链接 | |
| 建议 | rtracklayer，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | r453plus1toolbox_1.47.0.tar.gz |
| Windows二进制 | r453plus1toolbox_1.47.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | r453plus1toolbox_1.47.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r453plus1toolbox |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/r453plus1toolbox |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/r453plus1toolbox/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
