- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- R3CPET(开发版)
R3CPET
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DOI:10.18129 / B9.bioc.R3CPET
这是发展R3CPET版本;稳定的发布版本,请参阅R3CPET。
3 cpet:找到辅助因子复合物在Chia-PET实验中使用分层狄利克雷的过程
Bioconductor版本:发展(3.17)
包提供了一组方法来推断的蛋白质更可能共同维护chormatin交互ChIA-PET实验结果。
作者:杨Djekidel MN, Chen等人。
维护人员:穆罕默德Nadhir Djekidel < djek。nad gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“R3CPET”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“R3CPET”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“R3CPET”)
| R脚本 | 3 cpet:找到辅助因子复合物保持Chia-PET交互 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 贝叶斯,GeneExpression,GenePrediction,GraphAndNetwork,嗝,网络,NetworkInference,软件 |
| 版本 | 1.31.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(8年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.2),Rcpp(> = 0.10.4)方法 |
| 进口 | 方法、并行ggplot2,pheatmap,clValid,igraph,data.table,reshape2,Hmisc,RCurl,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.31.8),ggbio |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | BiocStyle,knitr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,biovizBase,biomaRt,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,闪亮的,ChIPpeakAnno |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/sirusb/R3CPET/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | R3CPET_1.31.0.tar.gz |
| Windows二进制 | R3CPET_1.31.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | R3CPET_1.31.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | R3CPET_1.31.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R3CPET |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ R3CPET |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/R3CPET/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/R3CPET/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
