Quasr.

DOI：10.18129 / b9.bioc.quasr.

这是发展Quasr的版本;对于稳定的版本版本，请参阅Quasr.。

量化和注释r的简短读数

Bioconductor版本：开发（3.13）

此包提供了框架，用于量化和分析短读数。它涵盖了从原始序列开始的完整工作流程，在创建对齐和质量控制图中，以定量感兴趣的基因组区域的量化。

作者：Anita Lerch [Aut]，Charlotte Soneson [Aut]，Dimos Gaidatzis [Aut]，Michael Stadler [Aut，Cre]

维护者：Michael Stadler

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！carcenameSpace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install的使用（版本='devel'）BiocManager :: Install（“Quasr”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“QUASR”）

HTML.	r script.	Quasr介绍
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	结盟那chipseq.那覆盖范围那遗传学那免疫学那Methylseq.那预处理那QualityControl.那rnaseq.那测序那软件
版本	1.31.2
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（8年）
执照	GPL-2
依靠	R（> = 4.0），并行，Genomicranges.那r
进口	方法，Grdevices，图形，Util，生物根系那S4Vectors.那绞喉那Biocmanager.那BioBase.那生物仪器那bsgenome.那RSAMTOOLS.那基因组法那缩短那生物相投那Genomeinfodb.那rtracklayer.那基因组夫妇那annotationdbi.， 工具
链接到	rhtslib.
建议	GVIZ.那生物焦那基因管理那Rhisat2.那kn那RAMAMAMDOW.那Covr.那testthat.
系统要求	GNU制作
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我	Eisar.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	quasr_1.31.2.tar.gz.
Windows二进制文件	quasr_1.31.2.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	quasr_1.31.2.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/quasr.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ quasr
包短网址	https://biocumon.org/packages/quasr/
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