QSUTILS

doi:10.18129/b9.bioc.qsutils

这是发展QSutils的版本;对于稳定版本,请参阅QSUTILS

准特性多样性

生物导体版本:开发(3.16)

使用NGS数据进行病毒准确分析的一组效用功能。大多数功能对于宏基因组研究同样有用。有三种主要类型:(1)数据操作和探索 - 可用于将读取转换为单倍型和频率,修复读数,相交链单倍型以及可视化单倍型比对的功能。(2)多样性指数 - 计算多样性和熵的功能,其中考虑了发病率,丰度和功能指数。(3)数据仿真 - 功能可用于生成随机病毒准确数据。

作者:梅赛德斯·格雷罗·穆里洛(Mercedes Guerrero-Murillo)[CRE,AUT],Josep Gregori I字体[aut]

维护者:ersedes guerrero-murillo

引用(从r内,输入引用(“ QSUTILS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ qsutils”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ QSUTILS”)

html R脚本 QSUTILS对准
html R脚本 QSUTILS多样性
html R脚本 QSUTILS模拟
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 结盟,,,,dnaseq,,,,DataImport,,,,遗传因素,,,,遗传学,,,,测序,,,,测序,,,,软件
版本 1.15.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(3.5岁)
执照 文件执照
要看 r(> = 3.5),生物弦,,,,生物基因, 方法
进口 ,统计心理
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,GGPLOT2
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 qSutils_1.15.0.tar.gz
Windows二进制 QSUTILS_1.15.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) QSUTILS_1.15.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qsutils
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/qsutils
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/qsutils/
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