π

DOI:10.18129 / B9.bioc.Pi

这是发展π的版本;稳定的发布版本,请参阅π。

利用遗传学证据优先考虑药物靶点的基因和通路水平

Bioconductor版本:发展(3.17)

优先级索引或πgenomic-led目标优先级系统开发。它集成了功能基因组预测,网络连接和免疫本体知识优先考虑潜在药物靶点的基因和通路水平。

作者:海方,ULTRA-DD财团,朱利安·C骑士

维护人员:海方< hfang。上海gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“π”)

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文档

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HTML	R脚本	π用户手册(R / Bioconductor包)
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneTarget,遗传学,GenomeWideAssociation,GraphAndNetwork,嗝,LinkageDisequilibrium,网络,通路,软件
版本	2.11.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	igraph,dnet,ggplot2、图形
进口	矩阵,GenomicRanges,GenomeInfoDb,supraHex,尺度grDevices,ggrepel,ROCR,randomForest,glmnet,晶格,脱字符号,plot3D、统计数据、方法质量,IRanges,BiocGenerics,dplyr,tidyr,ggnetwork,osfr,RCircos,purrr,readr,宠物猫
链接
建议	foreach,doParallel,BiocStyle,knitr,rmarkdown,png,GGally,gridExtra,ggforce,fgsea,RColorBrewer,ggpubr,rtracklayer,ggbio,Gviz,data.tree,jsonlite
SystemRequirements
增强了
URL	http://pi314.r-forge.r-project.org
BugReports	https://github.com/hfang-bristol/Pi/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Pi_2.11.0.tar.gz
Windows二进制	Pi_2.11.0.zip
macOS二进制(x86_64)	Pi_2.11.0.tgz
macOS二进制(arm64)	Pi_2.11.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Pi
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/π
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Pi/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Pi/
包下载报告	下载数据