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DOI:10.18129 / B9.bioc.PICS

这是发展版本的图片;稳定的发布版本,请参阅图片

概率推理的ChIP-seq

Bioconductor版本:发展(3.17)

使用一个经验贝叶斯概率推理的ChIP-Seq混合模型的方法。

作者:张Xuekui < xzhang stat.ubc。ca >,拉斐尔Gottardo < rgottard fhcrc.org >

维护人员:升Sauteraud <升井。在gmail.com sauteraud >

从内部引用(R,回车引用(“图片”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“图片”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“图片”)

HTML R脚本 图片的用户指南
PDF 参考手册

细节

biocViews ChIPseq,聚类,测序,软件,可视化
版本 2.43.0
Bioconductor自 BioC 2.6 (r - 2.11)(12.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.0.0)
进口 跑龙套、统计数据、图形、grDevices方法,IRanges,GenomicRanges,Rsamtools,GenomicAlignments
链接
建议 rtracklayer平行,knitr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/SRenan/PICS
BugReports https://github.com/SRenan/PICS/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 PICS_2.43.0.tar.gz
Windows二进制 PICS_2.43.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) PICS_2.43.0.tgz
macOS二进制(arm64) PICS_2.43.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PICS
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/图片
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/PICS/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PICS/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网