- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- 照片(开发版)
图片
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DOI:10.18129 / B9.bioc.PICS
这是发展版本的图片;稳定的发布版本,请参阅图片。
概率推理的ChIP-seq
Bioconductor版本:发展(3.17)
使用一个经验贝叶斯概率推理的ChIP-Seq混合模型的方法。
作者:张Xuekui < xzhang stat.ubc。ca >,拉斐尔Gottardo < rgottard fhcrc.org >
维护人员:升Sauteraud <升井。在gmail.com sauteraud >
从内部引用(R,回车引用(“图片”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“图片”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“图片”)
| HTML | R脚本 | 图片的用户指南 |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ChIPseq,聚类,测序,软件,可视化 |
| 版本 | 2.43.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.6 (r - 2.11)(12.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.0.0) |
| 进口 | 跑龙套、统计数据、图形、grDevices方法,IRanges,GenomicRanges,Rsamtools,GenomicAlignments |
| 链接 | |
| 建议 | rtracklayer平行,knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/SRenan/PICS |
| BugReports | https://github.com/SRenan/PICS/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 平 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | PICS_2.43.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PICS_2.43.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | PICS_2.43.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | PICS_2.43.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PICS |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/图片 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/PICS/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PICS/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
