- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- 完美的(开发版)
完美的
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DOI:10.18129 / B9.bioc.PERFect
这是发展版本的完美;稳定的发布版本,请参阅完美的。
排列为微生物数据过滤
Bioconductor版本:发展(3.18)
完美是一种新型的排列过滤方法旨在解决微生物数据处理两个有待解决的问题:(i)定义和量化损失过滤通过实现阈值,和(2)介绍和评估一个排列测试过滤损失提供一定程度的过度的过滤。
作者:Ekaterina Smirnova <叶。曹smirnova vcuhealth.org >, Quy < Quy。曹:umontana.edu >
维护人员:Quy曹< Quy。曹:umontana.edu >
从内部引用(R,回车引用(“完美”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“完美”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 分类,宏基因组,微生物组,测序,软件 |
| 版本 | 1.15.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(3.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.6.0), sn (> = 1.5.2) |
| 进口 | ggplot2 (> = 3.0.0),phyloseq(> = 1.28.0),动物园(> = 1.8.3)、心理(> = 1.8.4),数据(> = 3.6.0),矩阵(> = 1.2.14),fitdistrplus(> = 1.0.12),并行(> = 3.6.0) |
| 链接 | |
| 建议 | knitr、rmarkdown kableExtra ggpubr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/cxquy91/PERFect |
| BugReports | https://github.com/cxquy91/PERFect/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | |
| Windows二进制 | PERFect_1.15.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | PERFect_1.15.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | PERFect_1.15.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PERFect |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/完美的 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/PERFect/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PERFect/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
