这是发展过去的版本;对于稳定版本,请参阅过去的。
生物导体版本:开发(3.16)
过去采用GWAS输出并将SNP分配给基因,使用这些基因找到与基因相关的途径,并根据显着性绘制途径。实施用于读取GWAS输入数据的方法,查找与SNP相关的基因,计算富集评分和途径的重要性以及绘制途径。
作者:Thrash Adam [Cre,Aut],Deornellis Mason [AUT]
维护者:thrash adam
引用(从r内,输入引用(“过去”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“过去”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“过去”)
html | R脚本 | 过去的 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 基因烯,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 1.13.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(3年) |
执照 | GPL(> = 3) +文件执照 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | 统计,utils,dplyr,,,,rlang,,,,迭代器, 平行,foreach,,,,多帕尔,,,,QVALUE,,,,rtracklayer,,,,GGPLOT2,,,,基因组机,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/igbb/past |
BugReports | https://github.com/igbb/past/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | 过去_1.13.0.tar.gz |
Windows二进制 | 过去_1.13.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | 过去_1.13.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/past |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/过去 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/past/ |
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