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- Bioconductor 3.17
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- PAIRADISE(开发版)
PAIRADISE
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DOI:10.18129 / B9.bioc.PAIRADISE
这是发展PAIRADISE版本;稳定的发布版本,请参阅PAIRADISE。
PAIRADISE:配对分析微分同种型表达式
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个包实现了PAIRADISE程序检测微分同种型表达式之间的匹配在成对RNA-Seq复制数据。
作者:沛Demirdjian,应年,易建联兴
维修工:羌胡<羌族。胡锦涛在roswellpark.org >,沛Demirdjian < levondem ucla.edu >
从内部引用(R,回车引用(“PAIRADISE”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“PAIRADISE”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“PAIRADISE”)
| HTML | R脚本 | PAIRADISE |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.15.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.6),nloptr |
| 进口 | SummarizedExperiment,S4Vectors、统计数据、方法abind,BiocParallel |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | PAIRADISE_1.15.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PAIRADISE_1.15.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | PAIRADISE_1.15.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | PAIRADISE_1.15.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAIRADISE |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PAIRADISE |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/PAIRADISE/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PAIRADISE/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
