padog

doi:10.18129/b9.bioc.padog

这是发展Padog的版本;对于稳定版本,请参阅padog

途径分析,重叠基因(PADOG)的下降加权

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包实现了称为PADOG的通用基因集分析方法,该方法淡化了基因的重要性,而基因通常会累积要分析的基因集。该软件包还使用KeggdzPathwaysGeo软件包的24个公共数据集为基因集分析方法提供了基准测试。

作者:adi laurentiu tarca ;zhonghui xu

维护者:Adi L. Tarca

引用(从r内,输入引用(“ Padog”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ padog”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Padog”)

PDF R脚本 padog
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,软件,,,,两通道
版本 1.39.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.0.0),keggdzpathwaysgeo, 方法,生物酶
进口 林玛,,,,AnnotationDbi,,,,GSA,,,,foreach,,,,Dorng,hgu133plus2.db,hgu133a.db,keggrest,,,,nlme
链接
建议 多帕尔, 平行
系统要求
增强
URL
取决于我 blma
进口我 Egsea
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 padog_1.39.0.tar.gz
Windows二进制 padog_1.39.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) padog_1.39.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/padog
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/padog
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/padog/
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