OncoScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.OncoScore

这是发展OncoScore版本;稳定版请参见OncoScore．

识别潜在致癌基因的工具

Bioconductor版本:开发(3.17)

OncoScore是一种基于生物医学文献引用频率来衡量基因与癌症关联的工具。评分通过动态更新的网络查询从PubMed文献中评估。

作者:卢卡·德·萨诺[aut]，卡洛·甘巴科蒂·帕萨利尼[ctb]，罗科·皮亚扎[ctb]，丹尼尔·拉马佐蒂[cre, aut]，罗伯塔·斯皮内利[ctb]

维护者:Luca De Sano

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("OncoScore")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“OncoScore”)

PDF	R脚本	OncoScore
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，软件
版本	1.27.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(7年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	biomaRt， grDevices，图形，utils，方法
链接
建议	BiocGenerics，BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/danro9685/OncoScore
BugReports	https://github.com/danro9685/OncoScore
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	OncoScore_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	OncoScore_1.27.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	OncoScore_1.27.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	OncoScore_1.27.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OncoScore
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OncoScore
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/OncoScore/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OncoScore/
软件包下载报告	下载数据