Nebulosa

DOI:10.18129 / B9.bioc.Nebulosa

这是发展《星云》版本;稳定发布版本请参见Nebulosa．

使用核基因加权密度估计的单细胞数据可视化

Bioconductor版本:开发(3.17)

该软件包提供了基于基因加权密度估计的单细胞数据的增强可视化。星云从缺失的特征中恢复信号，并允许检查来自多个特征(如基因)的联合表达。Seurat和singlecel实验对象可以在星云中使用。

作者:Jose Alquicira-Hernandez

维护:Jose Alquicira-Hernandez

安装

要安装此包，启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" cloulosa ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“Nebulosa”)

超文本标记语言	R脚本	用星云可视化基因表达
超文本标记语言	R脚本	用星云可视化基因表达(在Seurat中)
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，GeneExpression，SingleCell，软件，可视化
版本	1.9.0
在Bioconductor公司	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)，ggplot2，拼接而成
进口	修拉，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，ks，矩阵，统计，方法
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，covr，嘘，食物，DropletUtils，igraph，BiocFileCache，SeuratObject
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/powellgenomicslab/Nebulosa
BugReports	https://github.com/powellgenomicslab/Nebulosa/issues
全靠我
进口我
建议我	SCpubr
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Nebulosa_1.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)	Nebulosa_1.9.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/Nebulosa
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/星云
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Nebulosa/
软件包下载报告	下载数据