NanoStringDiff

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringDiff

这是发展NanoStringDiff版本;稳定的发布版本,请参阅NanoStringDiff

微分表达式分析NanoString nCounter数据

Bioconductor版本:发展(3.18)

这个包利用广义线性模型(GLM)负二项家族的描述统计数据和允许多因素设计。NanoStrongDiff合并规模因素,计算出积极的控制和管理控制,和背景水平,从消极的控制,获得的模型框架,使所有提供的标准化信息NanoString nCounter分析仪是充分的利用。

作者:香港王<香港。王在uky.edu >,tingting zhai , chi wang

维护人员:婷婷翟<婷婷。翟隽在uky.edu >,香港王<香港。王在uky.edu >

从内部引用(R,回车引用(“NanoStringDiff”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“NanoStringDiff”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression,归一化,软件
版本 1.31.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年)
许可证 GPL
取决于 Biobase
进口 matrixStats、方法Rcpp
链接 Rcpp
建议 testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 纳米管
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 NanoStringDiff_1.31.0.tar.gz
Windows二进制 NanoStringDiff_1.31.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringDiff
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NanoStringDiff
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/NanoStringDiff/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringDiff/
包下载报告 下载数据

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