- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- NanoStringDiff(开发版)
NanoStringDiff
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringDiff
这是发展NanoStringDiff版本;稳定的发布版本,请参阅NanoStringDiff。
微分表达式分析NanoString nCounter数据
Bioconductor版本:发展(3.18)
这个包利用广义线性模型(GLM)负二项家族的描述统计数据和允许多因素设计。NanoStrongDiff合并规模因素,计算出积极的控制和管理控制,和背景水平,从消极的控制,获得的模型框架,使所有提供的标准化信息NanoString nCounter分析仪是充分的利用。
作者:香港王<香港。王在uky.edu >,tingting zhai
维护人员:婷婷翟<婷婷。翟隽在uky.edu >,香港王<香港。王在uky.edu >
从内部引用(R,回车引用(“NanoStringDiff”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“NanoStringDiff”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“NanoStringDiff”)
| R脚本 | NanoStringDiff装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,归一化,软件 |
| 版本 | 1.31.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | Biobase |
| 进口 | matrixStats、方法Rcpp |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | testthat,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 纳米管 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | NanoStringDiff_1.31.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NanoStringDiff_1.31.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringDiff |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NanoStringDiff |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/NanoStringDiff/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringDiff/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
