这是发展NBSplice版本;稳定的发布版本,请参阅NBSplice。
Bioconductor版本:发展(3.17)
方案提出了一种微分拼接基于同种型量化评价方法。应用广义线性模型与负二项分布来推断同种型相对表达的变化。
作者:加芙美利奴和埃尔默a·费尔南德斯
维护人员:加芙美利奴<美利奴。在gmail.com gabriela33 >
从内部引用(R,回车引用(“NBSplice”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“NBSplice”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
参考手册 |
biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,ImmunoOncology,RNASeq,回归,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.17.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(> = 3.5),方法 |
进口 | 刨边机统计数据,质量,车mppa,BiocParallel,ggplot2,reshape2 |
链接 | |
建议 | knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,rmarkdown,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.ar |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBSplice |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NBSplice |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NBSplice/ |
包下载报告 | 下载数据 |