MultiBaC

DOI:10.18129 / B9.bioc.MultiBaC

这是发展MultiBaC版本;稳定的发布版本,请参阅MultiBaC。

Multiomic批效应校正

Bioconductor版本:发展(3.18)

MultiBaC策略是正确的批处理影响multiomic数据集分布在不同的实验室或数据采集活动。MultiBaC是第一批效应校正算法处理批处理效应校正multiomics数据集。MultiBaC能够删除批处理效果在不同的组学内产生不同批次提供至少一个共同使数据类型包含在所有的批次。

作者:人(Manuel”、“Ugidos”、电子邮件=“manuelugidos@gmail.com”)、人(“索尼娅”,“Tarazona”,电子邮件=“sotacam@gmail.com”)、人(“玛丽亚·约瑟夫”、“Nueda”、电子邮件=“mjnueda@ua.es”)

维护人员:包维护者< manuelugidos gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“MultiBaC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MultiBaC”)

HTML	R脚本	MultiBaC
PDF		参考手册

细节

biocViews	BatchEffect,DataRepresentation,GeneExpression,PrincipalComponent,软件,StatisticalMethod,转录
版本	1.11.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	矩阵,ggplot2,MultiAssayExperiment,ropls、图形、方法、plotrix grDevices,pcaMethods
链接
建议	knitr rmarkdown,BiocStyle,devtools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MultiBaC_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	MultiBaC_1.11.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MultiBaC_1.11.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MultiBaC_1.11.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MultiBaC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MultiBaC
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MultiBaC/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MultiBaC/
包下载报告	下载数据