msfeatures

doi：10.18129/b9.bioc.msfeatures

这是发展MSFeatures的版本；对于稳定版本，请参阅msfeatures。

质谱特征的功能

生物导体版本：开发（3.16）

MSFeature软件包定义了质谱特征的功能。这包括基于其某些属性的组功能（LC-MS）功能，例如保留时间（凝聚功能）或跨样品信号的相关性。因此，此包装允许分组功能，其结果可以用作“ Qfeatures”软件包的输入，该输入允许每个组中汇总丰富的功能水平。该软件包定义了基本和常见数据类型的概念和功能，预计将在相应的软件包中实现更具体的数据类型的实现（例如``XCMS'）。该软件包的所有功能均以模块化的方式实现，该方式允许组合不同的分组方法，并可以在其他R软件包中重复使用。

作者：约翰内斯·雷纳[AUT，CRE]

维护者：约翰内斯·雷纳（Johannes Rainer）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ msfeatures”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ msfeatures”）

html	R脚本	分组质谱特征
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基础设施，，，，质谱，，，，代谢组学，，，，软件
版本	1.5.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.1）
进口	方法，蛋白质（> = 1.23.5），mscoreutils，，，，总结性特征，统计
链接
建议	测试，，，，roxygen2，，，，生物使用，，，，pheatmap，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/rformassspectrometry/msfeatures
BugReports	https://github.com/rformassspectrometry/msfeatures/issues
取决于我
进口我	XCMS
建议我	QMTools
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	msfeatures_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	msfeatures_1.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	msfeatures_1.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msfeatures
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/msfeatures
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/msfeatures/
软件包下载报告	下载统计