MsExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsExperiment

这是发展mexperimental版本;稳定版请参见MsExperiment．

质谱实验的基础设施

Bioconductor版本:开发(3.17)

存储和管理与完整的蛋白质组学或代谢组学质谱(MS)实验相关的所有方面的基础设施。mexperiment包为MS实验提供了轻量级和灵活的容器，构建在Spectra、QFeatures和相关包提供的新的MS基础设施上。除了原始数据表示、原始数据文件的链接和示例注释之外，还可以将其他元数据或注释存储在mexperimental容器中。为了保证最大的灵活性，只对容器内数据的类型和内容施加最小的约束。

作者:Laurent Gatto [aut, cre]，约翰·雷纳[au]，塞巴斯蒂安·吉布[au]

维护者:Laurent Gatto < Laurent。Gatto at uclouvain.be>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" mexperimental ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MsExperiment”)

超文本标记语言	R脚本	质谱实验管理
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ExperimentalDesign，基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.1.3
在Bioconductor	BioC 3.16 (R-4.2)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.2)，ProtGenerics(> = 1.9.1)
进口	方法,S4Vectors，IRanges，光谱，SummarizedExperiment，QFeatures
链接
建议	testthat，knitr(> = 1.1.0版),roxygen2，BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown，rpx，mzR，msdata
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsExperiment
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsExperiment/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MsExperiment_1.1.3.tar.gz
Windows二进制	MsExperiment_1.1.3.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MsExperiment_1.1.3.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MsExperiment_1.1.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsExperiment
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ msexperexperimental
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MsExperiment/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsExperiment/
软件包下载报告	下载数据